Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATG3Q9NT62 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms