Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARHGEF3Q9NR81 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARHGEF3Q9NR81 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms