Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECTIN3Q9NQS3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms