Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPCPD1Q9NPB8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms