Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSU72Q9NP77 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms