Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLXNA4Q9HCM2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms