Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPF2Q9HAU5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms