Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP44Q9H0E7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP44Q9H0E7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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