Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPR88Q9GZN0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPR88Q9GZN0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPR88Q9GZN0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPR88Q9GZN0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPR88Q9GZN0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPR88Q9GZN0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPR88Q9GZN0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GPR88Q9GZN0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GPR88Q9GZN0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GPR88Q9GZN0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPR88Q9GZN0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms