Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms