Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CIPCQ9C0C6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms