Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC94Q9BW85 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms