Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB2BQ9BVA1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms