Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFHD1Q9BUP0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms