Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C16orf70Q9BSU1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C16orf70Q9BSU1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms