Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDF4Q9BRK5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms