Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CRAMP1Q96RY5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 338 ms