Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGAP1Q96PV0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms