Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms