Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms