Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms