Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI9

CXorf58, Putative uncharacterized protein CXorf58, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf58Q96LI9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXorf58Q96LI9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXorf58Q96LI9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms