Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAF2Q96CS3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms