Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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