Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKD1Q969G9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD1Q969G9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms