Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HGDQ93099 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HGDQ93099 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HGDQ93099 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HGDQ93099 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HGDQ93099 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HGDQ93099 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HGDQ93099 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HGDQ93099 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HGDQ93099 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HGDQ93099 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HGDQ93099 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGDQ93099 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGDQ93099 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGDQ93099 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HGDQ93099 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms