Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TRIM41Q8WV44 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms