Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 OSBPL3-204ENST00000409069 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 MSL3-207ENST00000398527 2324 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 UGT1A10-201ENST00000344644 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 GCM1-201ENST00000259803 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SVIPQ8NHG7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms