Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGBL3Q8NEM8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGBL3Q8NEM8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms