Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCO5AQ8N6Q1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms