Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNF182Q8N6D2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF182Q8N6D2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms