Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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LINC00518Q8N0U6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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LINC00518Q8N0U6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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LINC00518Q8N0U6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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LINC00518Q8N0U6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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LINC00518Q8N0U6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LINC00518Q8N0U6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LINC00518Q8N0U6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00518Q8N0U6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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