Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms