Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUFY3Q7L099 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUFY3Q7L099 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms