Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BEND4Q6ZU67 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms