Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC73Q6ZRK6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC73Q6ZRK6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms