Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX73

C16orf89, UPF0764 protein C16orf89, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf89Q6UX73 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf89Q6UX73 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf89Q6UX73 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms