Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms