Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L9Q6RFH8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms