Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A47Q6Q0C1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A47Q6Q0C1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms