Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA3EQ6PEY2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms