Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CSAG1Q6PB30 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms