Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
REEP3Q6NUK4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms