Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NANOGP8Q6NSW7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NANOGP8Q6NSW7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms