Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms