Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMYD5Q6GMV2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMYD5Q6GMV2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms