Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF6Q5VXH4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms