Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOCADQ5VW36 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms