Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3CQ5T2N8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms