Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PIK3CD-AS1Q5SR53 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms